Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms