Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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