Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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