Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc183A2AJB1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms