Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramel3A2AHA7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms