Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl9-ps1S4R1R7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl9-ps1S4R1R7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl9-ps1S4R1R7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 790 ms