Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top3bQ9Z321 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3bQ9Z321 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top3bQ9Z321 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms