Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria4Q9Z2W8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gria4Q9Z2W8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria4Q9Z2W8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria4Q9Z2W8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms