Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt16Q9Z2K1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt16Q9Z2K1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt16Q9Z2K1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt16Q9Z2K1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms