Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd1Q9Z2E2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd1Q9Z2E2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd1Q9Z2E2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd1Q9Z2E2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd1Q9Z2E2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd1Q9Z2E2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms