Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rlbp1Q9Z275 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rlbp1Q9Z275 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rlbp1Q9Z275 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rlbp1Q9Z275 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rlbp1Q9Z275 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rlbp1Q9Z275 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rlbp1Q9Z275 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rlbp1Q9Z275 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rlbp1Q9Z275 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rlbp1Q9Z275 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rlbp1Q9Z275 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms