Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn8Q9Z260 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn8Q9Z260 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn8Q9Z260 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn8Q9Z260 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn8Q9Z260 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn8Q9Z260 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn8Q9Z260 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn8Q9Z260 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms