Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uso1Q9Z1Z0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uso1Q9Z1Z0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Uso1Q9Z1Z0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uso1Q9Z1Z0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms