Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ap3b1Q9Z1T1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ap3b1Q9Z1T1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms