Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApomQ9Z1R3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ApomQ9Z1R3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApomQ9Z1R3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms