Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VarsQ9Z1Q9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VarsQ9Z1Q9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.5 ms