Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nek4Q9Z1J2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek4Q9Z1J2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek4Q9Z1J2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek4Q9Z1J2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek4Q9Z1J2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms