Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl8Q9Z121 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl8Q9Z121 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl8Q9Z121 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms