Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
NgfrQ9Z0W1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NgfrQ9Z0W1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NgfrQ9Z0W1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms