Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn2Q9Z0I6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn2Q9Z0I6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn2Q9Z0I6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn2Q9Z0I6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slfn2Q9Z0I6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms