Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E0

Ncdn, Neurochondrin, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcdnQ9Z0E0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcdnQ9Z0E0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NcdnQ9Z0E0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcdnQ9Z0E0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcdnQ9Z0E0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcdnQ9Z0E0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcdnQ9Z0E0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcdnQ9Z0E0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcdnQ9Z0E0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms