Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap4s1Q9WVL1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap4s1Q9WVL1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4s1Q9WVL1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap4s1Q9WVL1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap4s1Q9WVL1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms