Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn5Q9WVD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn5Q9WVD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn5Q9WVD4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms