Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx1Q9WV80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx1Q9WV80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms