Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnni1Q9WUZ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni1Q9WUZ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni1Q9WUZ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms