Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnip1Q9WUU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tnip1Q9WUU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnip1Q9WUU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnip1Q9WUU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms