Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scnn1bQ9WU38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scnn1bQ9WU38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scnn1bQ9WU38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms