Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTW5

Slc22a3, Solute carrier family 22 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a3Q9WTW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc22a3Q9WTW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc22a3Q9WTW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc22a3Q9WTW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc22a3Q9WTW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc22a3Q9WTW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc22a3Q9WTW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a3Q9WTW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a3Q9WTW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc22a3Q9WTW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a3Q9WTW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a3Q9WTW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a3Q9WTW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms