Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Usp18Q9WTV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp18Q9WTV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Usp18Q9WTV6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Usp18Q9WTV6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Usp18Q9WTV6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp18Q9WTV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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