Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc2Q9R244 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc2Q9R244 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc2Q9R244 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc2Q9R244 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms