Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sae1Q9R1T2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sae1Q9R1T2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sae1Q9R1T2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms