Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Taf7Q9R1C0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf7Q9R1C0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf7Q9R1C0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Taf7Q9R1C0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Taf7Q9R1C0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms