Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod1Q9R0E2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod1Q9R0E2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms