Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Plod3Q9R0E1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plod3Q9R0E1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Plod3Q9R0E1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod3Q9R0E1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms