Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lamc3Q9R0B6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lamc3Q9R0B6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Lamc3Q9R0B6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Lamc3Q9R0B6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Lamc3Q9R0B6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
Lamc3Q9R0B6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms