Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tk2Q9R088 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk2Q9R088 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms