Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkab1Q9R078 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab1Q9R078 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prkab1Q9R078 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkab1Q9R078 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms