Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcamQ9R069 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcamQ9R069 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcamQ9R069 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcamQ9R069 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcamQ9R069 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BcamQ9R069 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BcamQ9R069 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcamQ9R069 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BcamQ9R069 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms