Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsjQ9R014 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsjQ9R014 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtsjQ9R014 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms