Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf25Q9QZR0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf25Q9QZR0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf25Q9QZR0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms