Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn8Q9QZ49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubxn8Q9QZ49 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn8Q9QZ49 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms