Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt3Q9QZ47 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnnt3Q9QZ47 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt3Q9QZ47 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt3Q9QZ47 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms