Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp3Q9QY23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp3Q9QY23 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp3Q9QY23 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms