Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ehd3Q9QXY6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ehd3Q9QXY6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ehd3Q9QXY6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms