Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apbb1Q9QXJ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apbb1Q9QXJ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apbb1Q9QXJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms