Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-OaQ9QWV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-OaQ9QWV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-OaQ9QWV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2-OaQ9QWV1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2-OaQ9QWV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-OaQ9QWV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms