Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mid2Q9QUS6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mid2Q9QUS6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mid2Q9QUS6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid2Q9QUS6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms