Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma6Q9QUM9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psma6Q9QUM9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma6Q9QUM9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms