Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl2Q9QUK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl2Q9QUK0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkl2Q9QUK0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms