Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoaQ9QUI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoaQ9QUI0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms